Το Detective Academy Q ασχολείται με μια ομάδα απο συμμαθητές (Kyū Renjō, Megumi Minami, Ryū Amakusa, Kazuma Narusawa, Kintarō Tōyama) στην τάξη Q του σχολείου για ιδιωτικούς ερευνητές (ντιτέκτιβ) DDS (Dan Detective School) που δημιουργήθηκε από τον Dan Morihiko, τον πιο διάσημο ντετέκτιβ στην Ιαπωνία.
Μαζί λύνουν διάφορες υποθέσεις και αποτρέπουν τα σχέδια μιας τρομοκρατικής οργάνωσης με το όνομα Pluto.