Το X αναφέρεται στην ιστορία ενός νέου, του Shirou Kamui ο οποίος έχει κρυμμένη μια προφητεία στο όνομα του. Ή να καταστρέψει τον κόσμο, ή να τον σώσει από την καταστροφή. Αν αποφασίσει να καταστρέψει τον κόσμο, θα έχει στο πλευρό του τους 7 Angels και αν αποφασίσει να τον σώσει, τους 7 Seals. Φυσικά τα πράγματα δεν είναι τόσο απλά μιας και ο Kamui έχει ένα Δίδυμο Αστέρι (Gemini) ο οποίος θα γίνει το αντίθετο από αυτό που θα επιλέξει και έτσι είναι γραφτό τους να έρθουν αντιμέτωποι για την μοίρα του πλανήτη.
Επίσης αξίζει να σημειωθεί ότι υπάρχει και μια
X σειρά που κυκλοφόρησε λίγα χρονιά αργότερα.