Ο πόλεμος του Tokugawa Shogunate έχει τελειώσει εδώ και πολύ καιρό, υπάρχουν όμως και κάποιοι που δεν έμειναν ευχαριστημένοι από το αποτέλεσμα.
Ο Shigure Takimi ένας ικανός ξιφομάχος ήταν μάρτυρας του καλύτερου φίλου του, ο οποίος σκοτώθηκε από τα χέρια του Ηimura Kenshin, γνωστός τότε στον πόλεμο ως "Hitokiri Batusai". Ο Shigure oρκισμένος για εκδίκηση για τον θάνατο της οικογένειας και του καλύτερου φίλου του, σχηματίζει μια ομάδα από επαναστάτες προκειμένου να καταστρέψει την κυβέρνηση της Ιαπωνίας.
Ο μόνος που μπορεί να αντιμετωπίσει τον Shigure, δεν είναι άλλος από τον Kenshin...