Ο Lupin ο τρίτος έχει εκτελεστεί, αλλά είναι ακόμα ζωντανός και ακόμη και ο Lupin ο ίδιος δεν καταλαβαίνει γιατί.
Ενώ προσπαθεί να το καταλάβει, παρόλα αυτά, αυτός και η συμμορία του εμπλέκονται σε μία συνωμοσία που αφορά κλώνους, την όχι και πολλή εμπιστευτική του αντίπαλο Fujiko και το σχέδιο ενός τρελού να κατακτήσει τον κόσμο...