Η ιστορία του Big O ξεκινάει 40 χρόνια μετά από το "συμβάν"(The Event) το οποίο κατάστρεψε την πόλη Paradign και έσβησε την μνήμη των κατοίκων της. Σήμερα οι κάτοικοι της πόλης χρησιμοποιούν την τότε τεχνολογία μη γνωρίζοντας τι ακριβώς συνέβη τότε.
Ο κύριος χαρακτήρας Roger Smith αλλιώς γνωστός και ως "Διαπραγματευτής" προστατεύει την πόλη και ταυτόχρονα ερευνά το μυστήριο παρελθόν του μαζί με τους σύμμαχους του, την Dorothy - ένα ανδροειδές, τον μπάτλερ του Norman, και ένα γιγάντιο mecha αποκαλούμενο "the Big O".